NBRC／微生物ゲノムDNA

	微生物ゲノムDNAに関するミニアンケート
	NBRCでは今後ゲノムDNAの分譲対象株を増やしていく予定です。そのため、ゲノムDNAをご要望される微生物株についてのアンケートに皆様のご協力をよろしくお願い致します。

ゲノムDNA提供可能微生物株一覧
Fungi and Yeasts / Bacteria / Archaea
NBRC番号	微生物名	株名	注記
■Fungi and Yeasts
100959G	Aspergillus oryzae	NBRC 100959 = RIB 40	ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN] ※1
1136G	Saccharomyces cerevisiae	NBRC 1136 = S288C	ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ]
■Bacteria
3283G	Acetobacter pasteurianus	NBRC 3283 = 46	ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN][DDBJ]
102363G	Actinoplanes missouriensis	NBRC 102363 = 431	基準株ゲノム塩基配列決定株 [NCBI] ※2
15112G	Amphibacillus xylanus	NBRC 15112 = Ep01	基準株
100420G	Anaerolinea thermophila	NBRC 100420 = UNI-1	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN]
105658G NEW!!	Armatimonas rosea	NBRC 105658 = YO-36	基準株
15305G NEW!!	Bacillus cereus	NBRC 15305 = ATCC 14579	基準株ゲノム塩基配列決定株 [NCBI]
13719G	Bacillus subtilis subsp. subtilis	NBRC 13719	基準株
100599G	Brevibacillus brevis	NBRC 100599 = 47	ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN][DDBJ]
104884G	Burkholderia plantarii	NBRC 104884 = AZ 8201	基準株ゲノム塩基配列決定株 [NCBI]
100824G	Caldanaerobacter subterraneus subsp. tengcongensis	NBRC 100824 = MB4	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ] ※3 ※4
104410G	Caldisericum exile	NBRC 104410 = AZM16c01	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN]
13948G	Clostridium acetobutylicum	NBRC 13948 = 2291 = ATCC 824	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ] ※2
12016G	Clostridium kluyveri	NBRC 12016 = K-1 = DSM 555	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ]
103400G	Clostridium thermocellum	NBRC 103400 = VPI 7372 = ATCC 27405	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ]
100395G	Corynebacterium efficiens	NBRC 100395 = YS-314	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN] [DDBJ]
12168G	Corynebacterium glutamicum	NBRC 12168 = 534	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ]
101012G	Deferribacter desulfuricans	NBRC 101012 = SSM1	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN][DDBJ] ※4
104933G	Desulfovibrio magneticus	NBRC 104933 = RS-1	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN][DDBJ] ※4
12713G	Escherichia coli	NBRC 12713 = W3110	ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ]
100505G	Gemmatimonas aurantiaca	NBRC 100505 = T-27	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN] [DDBJ]
3288G	Gluconacetobacter xylinus	NBRC 3288 = 51	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ]
16485G	Hydrogenobacter subterraneus	NBRC 16485 = HGP1	基準株
14216G	Kitasatospora setae	NBRC 14216 = KM-6054	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN][DDBJ]
14940G	Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae	NBRC 14940 = KM 2924 = NCTC 9633	基準株
103217G	Kocuria rhizophila	NBRC 103217 = DC2201	ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN][DDBJ]
13120G	Lactobacillus homohiochii	NBRC 13120 = RIB 9124
101784G	Microlunatus phosphovorus	NBRC 101784 = NM-1	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN][DDBJ]
14854G	Mycoplasma fermentans	NBRC 14854 = PG18	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ] ※3 ※5
14477G	Mycoplasma orale	NBRC 14477 = CH19299	基準株 ※3 ※5
14401G	Mycoplasma pneumoniae	NBRC 14401 = FH	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ] ※2 ※3 ※5
106052G	Pseudomonas aeruginosa	NBRC 106052 = PAO1	ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ]
100887G	Rhodococcus erythropolis	NBRC 100887 = PR4	ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN][DDBJ]
100245G NEW!!	Rubrivivax gelatinosus	NBRC 100245 = IL144	ゲノム塩基配列決定株 [NCBI]
100952G	Rubrobacter xylanophilus	NBRC 100952 = PRD-1	基準株ゲノム塩基配列決定株 [NCBI] ※2
13245G	Salmonella enterica subsp. enterica	NBRC 13245 = LT 2 = TM 2	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ]
101211G	Sphingobium japonicum	NBRC 101211 = UT26S	ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN][DDBJ]
100910G	Staphylococcus aureus subsp. aureus	NBRC 100910 = AJ 1060	基準株 ※1
14893G	Streptomyces avermitilis	NBRC 14893 = MA-4680	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN][DDBJ] ※4
12172G	Tetragenococcus halophilus	NBRC 12172 = d-6	ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ]
103674G	Thermosulfidibacter takaii	NBRC 103674 = ABI70S6	基準株 ※2
100826G	Thermotoga maritima	NBRC 100826 = MSB8	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ] ※2
101084G	Thermus thermophilus	NBRC 101084 = HB8	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ]
13303G	Xanthomonas campestris	NBRC 13303	※1 ※6
■Archaea
100138G	Aeropyrum pernix	NBRC 100138 = K1	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN] [DDBJ]
100126G	Archaeoglobus fulgidus	NBRC 100126 = VC-16 = DSM 4304	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ] ※2
100127G	Archaeoglobus profundus	NBRC 100127 = AV18 = DSM 5631	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ] ※4
100440G	Methanocaldococcus jannaschii	NBRC 100440 = JAL-1 = DSM 2661	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ] ※2
101707G	Methanocella paludicola	NBRC 101707 = SANAE	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN][DDBJ]
103675G	Methanosaeta concilii	NBRC 103675 = GP6	基準株
101360G	Methanosaeta thermophila	NBRC 101360 = P_T	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ]
100939G	Methanosarcina acetivorans	NBRC 100939 = C2A	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ] ※2
100474G	Methanosarcina barkeri	NBRC 100474 = MS	基準株参考：M. barkeri Fusaroゲノム配列 [DDBJ]
100330G	Methanothermobacter thermautotrophicus	NBRC 100330 = ΔH	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ] ※4
100828G	Picrophilus torridus	NBRC 100828 = KAW 2/3 = DSM 9790	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ] ※4
100827G	Pyrobaculum aerophilum	NBRC 100827 = IM2	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ]
100139G	Pyrococcus horikoshii	NBRC 100139 = OT3	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN] [DDBJ]
100439G	Pyrodictium abyssi	NBRC 100439 = AV 2	基準株 ※3
15157G	Sulfolobus acidocaldarius	NBRC 15157 = DSM 639	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ]
15437G	Sulfolobus shibatae	NBRC 15437 = B 12	基準株
100140G	Sulfolobus tokodaii	NBRC 100140 = 7	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DOGAN] [DDBJ]
15161G	Sulfurisphaera ohwakuensis	NBRC 15161 = TA 1	基準株
101555G	Thermococcus celericrescens	NBRC 101555 = TS2 = DSM 17994	基準株 ※4
15155G	Thermoplasma acidophilum	NBRC 15155 = 122-1B2 = DSM 1728	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ] ※2 ※3
15438G	Thermoplasma volcanium	NBRC 15438 = GSS 1	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ]
100435G	Thermoproteus tenax	NBRC 100435 = Kra 1	基準株ゲノム塩基配列決定株 [DDBJ] ※3
100879G	Vulcanisaeta souniana	NBRC 100879 = IC-059	基準株 ※2

※1：分譲するゲノムDNAには、外国為替及び外国貿易法第四十八条第一項に規定される特定の種類の貨物（戦略物資株）に該当する、または該当する疑いのある遺伝子が含まれています。そのため、日本国外への分譲を行いません。また、分譲のお申し込みの際には、「生物遺伝資源利用誓約書」が必要となりますので、予めご承知おき願います。
※2：ゲノムDNAの長さは平均10kbp以上となります。
※3：最低保証分譲量は500ngとなります。
※4：ゲノムDNAの長さは平均10kbp以下となります。
※5： 16S-23S ITS領域をPCR法により確認しています。
※6： Xanthomonas campestris NBRC 13303は、植物防疫法に基づく輸入検疫有害菌となります。抽出したゲノムDNAは輸入検疫有害菌に該当しませんが、植物防疫所の指示により、分譲依頼者並びに送付先に記載のお名前とご所属、分譲年月日を植物防疫所へ報告いたしますことを予めご承知おき願います。

品質確認について

NBRCより分譲している微生物ゲノムDNAにつきましては、下記の品質確認を行っています。

■濃度の確認
ご依頼毎に行っておりますゲノムDNA抽出後に濃度を測定し、分譲量が１μg以上であることを確認しています。
（注）一部の微生物株については、最低保証分譲量が500ngとなります。

■PCR反応による酵素反応の確認
ご依頼毎に抽出したゲノムDNAを鋳型とした16S rDNA領域のPCR増幅とその産物の電気泳動を行い、酵素反応が阻害されないことを確認しています。

■16S rDNA領域の塩基配列の確認
培養ロット毎に16S rDNA領域の塩基配列を決定し、公共データベース上の塩基配列と一致していることを確認しています。

（注）生物学上培養により突然変異を生じている領域が存在する可能性があります。ご利用される前に目的領域をシーケンス等で確認されることをお薦め致します。

■パルスフィールド電気泳動による長さの確認
培養ロット毎にゲノムDNAの抽出を行い、抽出されるゲノムDNAが20kbp以上の長さとなることを確認しています。

（注）一部の微生物株について、抽出されるゲノムDNAの長さが20kb以上となっていない場合があります。

微生物ゲノムDNAのお申込について

微生物ゲノムDNAのお申し込み方法: ゲノムDNAのご依頼は、「生物遺伝資源分譲依頼書及び誓約書（DNA用）」 ( 248KB)に必要事項を全てご記入頂き、押印の上、郵便またはファックスにて下記宛にお申し込みください。（電話やE-Mailでのお申し込みは承っておりません。)
　なお、「生物遺伝資源の名称」の欄には、分譲を希望するNBRC番号を正確に全てご記入ください。

■ お申し込み先
〒２９２－０８１８
千葉県木更津市かずさ鎌足２－５－８
独立行政法人製品評価技術基盤機構
バイオテクノロジーセンター
生物資源課（ＮＢＲＣ）

FAX: ０４３８－５２－２３２９

NBRC番号について: ゲノムDNAのNBRC番号は、「対応する微生物株のNBRC番号」＋「G」となっております。「G」の記入忘れ等、NBRC番号のご記入には特にご留意ください。
　ゲノムDNAによっては、培養状況・保存状況・法的規制等により今後分譲対象から除外したり、分譲条件等を変更することがあります。
微生物ゲノムDNAの送付について: ゲノムDNAは、抽出したゲノムDNA（1～3µg）を乾燥品としてお送りします。（一部のゲノムDNAの分譲量は0.5µg以上となります。）
　お送りしたゲノムDNAの品質に問題がありましたら、受領後1ケ月以内にご連絡ください。

各種書類のダウンロード

様式	内容	ダウンロード
生物遺伝資源分譲依頼書及び誓約書（DNA用）	入手のご依頼には、同意書への同意及び捺印が必要です。同意書は、分譲依頼書に記載しておりますので必ずご一読下さい。	248KB 記入例 ( 48KB)

微生物ゲノムDNAの分譲手数料について

分譲手数料は、右表のとおりとなっております。
　支払い方法としては、銀行振込とクレジットカード（Visa, MasterCard）がご利用になれます。クレジットカード払いご希望の場合は、分譲依頼書の「支払方法」欄の「クレジットカード」をご選択の上、ご依頼ください。

　ゲノムDNAの入手に際し、ご不明な点などがございましたら、下記のメールアドレスまでお問い合わせをお願い致します。
連絡先：dna@nite.go.jp

1サンプルあたり・消費税、送料込み
大学、教育機関、国公立試験研究機関	10,500円
その他の民間試験研究機関	21,000円

お願い

入手したゲノムＤＮＡをさらに第三者に分譲することはご遠慮ください。
本ゲノムＤＮＡを用いて得られた成果を論文や学会等で公表する際には、
1. 使用したゲノムＤＮＡのNBRC番号
2. 使用したゲノムＤＮＡの分譲元が「NBRC, NITE, Kisarazu, Japan」
であることを明記いただければ幸いです。また、併せて当該論文の掲載雑誌名や巻号頁数等の情報やPDFファイル等をdna@nite.go.jpまでお送り頂ければ幸いに存じます。
本ゲノムＤＮＡを用いて商品開発等をされた場合には、当該商品についての案内を事後で結構ですのでお教え頂ければ幸いです。なお、お送りいただきました情報につきましては、NBRCのゲノムＤＮＡをご利用頂いた例として差し支えない範囲でご紹介させて頂くこともございます。

独立行政法人製品評価技術基盤機構
バイオテクノロジーセンター
生物資源課

JQA-QMA13036

〒292-0818
千葉県木更津市かずさ鎌足2-5-8
TEL：0438-20-5763　FAX：0438-52-2329

Mail：	nbrc@nite.go.jp
地図：	広域地図詳細地図［かずさ（千葉）／本所（東京）］